تصنف المخطوطات القبطية مثل نصوص الكتاب المقدس والقوانين الكنسية وسير القديسين والمواعظ والصلوات والطب وعلاوة علي المخطوطات التي تناولت تاريخ الكنيسة القبطية، وتناولت المخطوطات عدة موضوعات مثل سير القديسين والكتاب المقدس، كما أمدتنا بعض تلك الوثائق بمعلومات هامة عن مظاهر الحياة الاجتماعية.